预算审核是企业管理中非常重要的一环，而申请单位的变更请求是预算审核中常见的问题。在处理这种情况时，我们需要考虑以下几个方面：
变更请求的合理性：首先需要评估变更请求的合理性，看看这个请求是否合理，是否符合公司的战略规划和经营计划。如果变更请求不合理，那么就需要拒绝这个请求。
变更请求的影响：如果变更请求合理，那么需要评估这个请求对预算的影响。需要考虑这个请求是否会影响公司的利润、现金流等财务指标，如果会有影响，那么需要重新评估这个预算方案。
变更请求的处理方式：如果变更请求合理且对预算影响较小，那么可以直接在原有预算方案中进行修改。如果变更请求对预算影响较大，那么就需要重新编制预算方案。
处理变更请求时需要注意的几个问题：
变更请求的发起时间：变更请求需要在预算编制前或预算执行过程中及时提出，否则可能会对公司的经营计划产生较大影响。
变更请求的细节：需要对变更请求进行详细的说明，包括变更的原因、变更的内容、变更的影响等等。
变更请求的审批流程：需要建立完善的变更请求审批流程，明确变更请求的审批权限和流程，确保变更请求的处理符合公司的规定和标准。
总之，在处理申请单位的变更请求时，需要综合考虑变更请求的合理性、影响和处理方式，并建立完善的审批流程，以确保预算的编制和执行符合公司的战略规划和经营计划。